1941年——与唐一禾、吕霞光、黄显之、吕斯百、秦宣夫、李瑞年、王临乙在成都举行八人美术联展。在第三次全国美术展览中展出油画《空袭下的母亲》、《不可毁灭的生命》等作品。
1942年——列名为教育部美术教育委员会委员，受教育部之聘为终身教授；任中国美术学院研究员。作油画《自画像》、《碉楼旧居》等。
1943年——四月至一九四四年初，赴成都、兰州、西宁、敦煌莫高窟等地旅行写生、临摹古代 壁画。赴玉门油矿收集素材、为全国矿冶展览会作大幅油画《玉门油矿》。
1944年——三月，在成都与刘开渠、雷圭元、丁聪、沈福文、秦威等组织现代美术会，并举行首次展览会。作油画《祭青海》等。
1944年——六月至一九四五年二月，赴青康藏地区旅行写生。作速写和水彩多幅，并开始创作中国画。在康定举行个人画展。展出新作品有：油画《玉树》、《青海市场》等。
1945年——五月在成都举办"吴作人旅边画展"。同年十二月在重庆举办"吴作人画作回顾展"。展出旅边写生、莫高窟所临壁画以及战火中幸存的习作，徐悲鸿、郭有守、陶行知、郑君里等先后在蓉渝两地报刊上撰文评述。
1946年——由重庆到上海。与张光字、丁聪等美术家组成上海美术作家协会，并举行第一次联展。在画展中与同为会员并参加画展的萧淑芳女士重逢。在上海举办"吴作人边疆旅行画展"。八月应徐悲鸿之聘到北平接管北平艺专，并任油画系教授兼教务主任。组织北平美术作家协会，任理事长。
1947年——应英国文化委员会邀请赴英国进行学术访问。五月在伦敦、七月在瑞士日内瓦、九月在法国巴黎分别举行个人画展。
1948年;—与萧淑芳结婚，徐悲鸿先生为证婚人，并赠《双骥图》。画上题诗：百年好合休嫌晚，茂实英声相接攀，譬如行程千万里，得看世界最高山。在北平组织北平美术作家协会、中国美术院、北平艺专联合展览会。参展作品有《古堡与坟场》（水彩）、《喇嘛寺跳神》（水彩，已佚）《惊马》（速写）、《兰州郊外》（油画）、《藏牦》（中国画）等。十二月七日在北平成立综合性艺术团体"一二七"艺术学会。
1949年——参加第一届全国文学艺术界代表大会。任全国美术家协会常务理事。作油画《解放南京号外》。
1950年——中央美术学院成立，任油画系教授兼教务长。到工厂、农村、草原牧区，水库工地深入生活，写生
1951年——参加中国文化代表团，访问印度、缅甸。并作速写多幅。
1952年——任炳灵寺石窟艺术勘察团副团长，对石窟艺术作发掘整理和临摹工作。参加北京人民英雄纪念碑设计工作，任美术组副组长。
1953年——任麦积山石窟艺术勘察团团长，对石窟艺术进行勘察、临摹、石刻翻模等。
当选为中国美术家协会副主席，中国文学艺术界联合全国委员会主席团委员。
1954年——是年起当选为第一至第六届全国人民代表大会代表。作油画《齐白石像》。
1955年——任中央美术学院副院长。作为中国代表团成员出席斯德哥尔摩世界裁军会议。赴内蒙古写生。作油画《草原云雨》、《雨中草原》、《原始林》、中国画《套马》、《少女像》等。
1956年——出席在瑞典隆德举行的国际艺术教育会议。与艾中信、萧淑芳、葛维墨等合作绘制北京天文馆西馆大厅天顶画，惜尽毁于十年动乱中。赴旅顺、大连写生。作油画《三门峡》等。
1957年——赴青岛写生。上海人民美术出版社出版《吴作人速写集》。
1958年——任中央美术学院院长。赴河北省束鹿县、涿县写生，创作油画《农民画家》、中国画《扁担萝筐》等。
1959年——出版《吴作人水墨画选》和油画专辑《海》，作油画《沙漠变绿洲》、《李大钊与孙中山》、《芍药》等。
1960年——赴宁夏旅行写生，为人民大会堂宁夏厅作中国画《枸杞园》、《进发》、《滩羊》。
1961年——赴东北写生。作油画速写多幅。
1962年——赴苏州、无锡等地写生。作中国画《太湖》、《渔》、《仙客来》及油画《月季》等。出版《吴作人画选》。人民美术出版社出版《吴作人画选》。
1963年——为祝贺中国运动员在二十八届世界乒乓球锦标赛中夺冠，作中国画《鹰击长空》。所作中国画《熊猫》由邮电部印制成第一套《熊猫》纪念邮票（共三枚）发行。
1964年——作中国画《知白守黑》、《忆漠上》等。
1965年——作中国画《芍药》。
1966年——"文化大革命"开始。自此年至一九七二年失去创作自由。
1969年——随中央美术学院师生下放河北省磁县部队农场劳动，赋《村北有荷塘》、《寐常少》等诗篇。
1972年——为国务院国宾馆作画，创作《吴哥朝晖》、《贡嘎雪峰》、《镜泊湖》等大幅油画和中国画多幅。作中国画《熊猫》，由邮电部印制成第二套《熊猫》特种邮票（共六枚）发行。作《任重道远》、《太湖鱼塘》、《横空出世》等。
1974年——赴天津大港油田写生，作油画《大海新貌》，并参加全国美展。
1975年——赴福建省武夷山等地写生，作有水墨速写《武夷山泉》、《象》等。
1976年——作中国画《武夷山下》（藏日本长崎唐人馆）、《警惕》、《金沙云崖》等。
